Es una de las herramientas por excelencia a la hora de buscar que carajos está utilizando el disco duro indiscriminadamente, particularmente el generador de miniaturas (thumbnails) de xfce, … y a últimas estaba fallando. Como suelo utilizar slackbuilds para instalar los paquetes que no se incluyen en Slackware, pensé por un momento que se había roto alguna dependencia, pero nope… el culpable es una actualización en el kernel.

Para los que son fresas y usan RedHat acá tienen la solución: 
https://access.redhat.com/solutions/2282161

Para los que no lo somos: 
https://unix.stackexchange.com/questions/446624/error-with-command-iotop-on-centos

Y bueno esencialmente los cambios en el kernel incluyen una línea en blanco que iotop no espera y truena, para esto se sugiere editar el siguiente script:
/usr/lib/python2.7/site-packages/iotop/data.py

Agregando esto en la línea 195:

if not line.strip(): continue

Debe quedar algo así:

Ojo con la identación que ya saben que python es sensible, también revisen el directorio en mi caso es lib64 ya que esa es la plataforma que tengo instalada, y voilá… iotop funcionará de nuevo.